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首次!《Nature》子刊揭示被忽略的基因變異如何影響免疫細胞
導 讀
mianyifanyingshijitizhongyaodefangyujizhi,baohurentimianshouwailaibingdudeqinxi,ruomianyifanyingchuxianwenti,zehuiyinfayixiliedejibingshenzhihuiweihaishengming。jinri,yixiangguanyumianyifanyingdeyanjiujieshileyinzangdeyichuanbianyiduimianyifanyingdeyingxiang。
zhenheshengwuzhuanlutiaokongguochengshidaliangdeshunshitiaokongyuanjianyufanshizuoyongyinzixianghuzuoyongdejieguo,juyoutiaokonggongnengdeshunfanyuanjiantongguojieheransezhikaifangquyucanyudaozhenheshengwuzhuanlutiaokongdeguochengzhongyikongzhizhuanluhuoxing。muqian,guanyutiaokongyuanjiandeyichuanbianyiduimianyifanyingyingxiangdexiangguanyanjiuyouxian,xiangyaoquedingmianyiyingdazhongdetiaokongyuanjianyichuanxiaoying,huoxuyaojiangsuoyoujiyinjianceyibian,zhewuyiyudahailaozhen。
近日,Wellcome Sanger研究所的研究人員利用人類誘導多能幹細胞(iPSC)產生的免疫細胞模擬人體的免疫反應,發現當免疫細胞處於特定狀態(例如激活時)時,由於調控元件遺傳變異引起的免疫應答會在特定的實驗階段顯現出來。
該研究結果以《Shared genetic effects on chromatin and gene expression indicate a role for enhancer priming in immune response》為題發表在1月29日的《Nature Genetics》上。
tongguoduijiyindedongtaijiance,yanjiurenyuanzhikandaoletiaokongyuanjianyichuanbianyixiaoyingdecanliuhenji,ertongguozhakanjiyindetiaokongquyu,tamenquedinglezhexieyichuanbianyiduimianyifanyingdezhenshiyingxiang,gaifangfayouliyurenmengenghaodilejietiaokongyuanjianyichuanbianyideyunxingjili,congerweimianyixitongjibingtigonggengjingquedebaxiangzhiliao。
研(yan)究(jiu)人(ren)員(yuan)發(fa)現(xian)人(ren)體(ti)免(mian)疫(yi)細(xi)胞(bao)中(zhong)的(de)調(tiao)控(kong)元(yuan)件(jian)遺(yi)傳(chuan)變(bian)異(yi)對(dui)沙(sha)門(men)氏(shi)菌(jun)等(deng)病(bing)原(yuan)體(ti)引(yin)起(qi)的(de)免(mian)疫(yi)反(fan)應(ying)的(de)影(ying)響(xiang)具(ju)有(you)條(tiao)件(jian)特(te)異(yi)性(xing),這(zhe)種(zhong)遺(yi)傳(chuan)變(bian)異(yi)效(xiao)應(ying)隻(zhi)在(zai)感(gan)染(ran)的(de)某(mou)些(xie)階(jie)段(duan)才(cai)可(ke)見(jian)。
因yin此ci,如ru果guo科ke學xue家jia們men沒mei有you對dui基ji因yin控kong製zhi區qu和he免mian疫yi細xi胞bao感gan染ran時shi各ge個ge階jie段duan的de調tiao控kong元yuan件jian進jin行xing研yan究jiu,那na麼me研yan究jiu結jie果guo就jiu可ke能neng忽hu略lve這zhe些xie遺yi傳chuan變bian異yi對dui免mian疫yi紊wen亂luan的de影ying響xiang。
研究人員利用iPSC產生的細胞來研究免疫應答中的調控元件遺傳效應,發現控製染色質可及性和基因表達的增強子可以增強免疫應答。該(gai)研(yan)究(jiu)結(jie)果(guo)對(dui)預(yu)先(xian)存(cun)在(zai)的(de)染(ran)色(se)質(zhi)分(fen)子(zi)開(kai)關(guan)的(de)遺(yi)傳(chuan)效(xiao)應(ying)在(zai)免(mian)疫(yi)激(ji)活(huo)過(guo)程(cheng)中(zhong)的(de)作(zuo)用(yong)進(jin)行(xing)說(shuo)明(ming),並(bing)強(qiang)調(tiao)這(zhe)些(xie)隱(yin)藏(zang)的(de)遺(yi)傳(chuan)效(xiao)應(ying)與(yu)免(mian)疫(yi)係(xi)統(tong)變(bian)異(yi)相(xiang)關(guan)性(xing)。
增強劑引發巨噬細胞的免疫反應
研究人員在體外將iPSC分化為巨噬細胞,讓這些細胞處於未受刺激、用信號分子幹擾素-γ刺激18小時後、沙門氏菌感染5小時後,幹擾素-γ刺激後再用沙門氏菌感染的這四種狀態中,他們發現,幹擾素-γ刺(ci)激(ji)後(hou)受(shou)沙(sha)門(men)氏(shi)菌(jun)感(gan)染(ran)的(de)免(mian)疫(yi)細(xi)胞(bao)已(yi)經(jing)準(zhun)備(bei)對(dui)沙(sha)門(men)氏(shi)菌(jun)發(fa)動(dong)免(mian)疫(yi)反(fan)應(ying),而(er)其(qi)他(ta)狀(zhuang)態(tai)下(xia)的(de)巨(ju)噬(shi)細(xi)胞(bao)則(ze)沒(mei)有(you)出(chu)現(xian)此(ci)類(lei)跡(ji)象(xiang)。這(zhe)表(biao)明(ming)遺(yi)傳(chuan)變(bian)異(yi)在(zai)免(mian)疫(yi)細(xi)胞(bao)的(de)準(zhun)備(bei)階(jie)段(duan)產(chan)生(sheng)了(le)影(ying)響(xiang)。實(shi)驗(yan)中(zhong)這(zhe)種(zhong)效(xiao)應(ying)是(shi)由(you)增(zeng)強(qiang)劑(ji)引(yin)發(fa),這(zhe)可(ke)能(neng)導(dao)致(zhi)與(yu)免(mian)疫(yi)紊(wen)亂(luan)相(xiang)關(guan)的(de)炎(yan)症(zheng)反(fan)應(ying)。
巨噬細胞免疫應答過程中增強子的作用
文章的的另一作者Gordon Dougan博士說:“zhexiangchengguoweijibingdeganranjizhiyanjiutigonglexindejianjie。ruguotiaokongyuanjianyichuanbianyiyujibingganranyouguan,namejiunengzaiganrandeguochengzhongkandaobianyitiaokongyuanjiandeyingxiang。zhejiangduijibingdezhiliaotigongyouxiaodebangzhu。”
前Wellcome Sanger研究所、愛沙尼亞塔爾圖大學的Kaur Alasoo博士補充到:“之(zhi)所(suo)以(yi)使(shi)用(yong)幹(gan)細(xi)胞(bao)而(er)不(bu)是(shi)預(yu)存(cun)的(de)的(de)血(xue)細(xi)胞(bao),是(shi)由(you)於(yu)幹(gan)細(xi)胞(bao)的(de)靈(ling)活(huo)性(xing)有(you)助(zhu)於(yu)我(wo)們(men)對(dui)其(qi)進(jin)行(xing)不(bu)同(tong)水(shui)平(ping)的(de)刺(ci)激(ji),從(cong)而(er)達(da)到(dao)不(bu)同(tong)的(de)效(xiao)果(guo)。我(wo)們(men)不(bu)僅(jin)對(dui)感(gan)染(ran)的(de)每(mei)一(yi)個(ge)階(jie)段(duan)都(dou)表(biao)達(da)的(de)基(ji)因(yin)進(jin)行(xing)了(le)分(fen)析(xi),還(hai)觀(guan)測(ce)到(dao)增(zeng)強(qiang)子(zi)的(de)活(huo)性(xing),這(zhe)使(shi)我(wo)們(men)發(fa)現(xian)了(le)遺(yi)傳(chuan)變(bian)異(yi)對(dui)免(mian)疫(yi)應(ying)答(da)的(de)隱(yin)藏(zang)效(xiao)應(ying)。”
zhexiangyanjiujieguoshuomingleyuxiancunzaideransezhihetiaokongyuanjiandeyichuanxiaoyingruhezaimianyijihuoguochengzhongbiaoda,bingqieqiangtiaolezhexieyinzangdeyichuanxiaoyingzaipoyijibingxiangguanbianyitideyanjiuzhongdezhongyaoxing。yanjiurenyuanxiangxinzhegexitongkezaixibaozhuangtaixiadeyanjiujiyin-環境相互作用的工作中發揮重要作用。此外,因為iPSC易於工程化,所以科學家們還可以在完全相同的細胞中直接測試因果變體的身份及其下遊結果。
來源:轉化醫學
參考資料:
1.Shared genetic effects on chromatin and gene expression indicate a role for enhancer priming in immune response
2.Study Suggests Molecular Switches, Plus Genes, Shape Role of Genetic Variation in Disease Risk
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